入選國家“中西部高�；A(chǔ)能力建設(shè)工程”、安徽省第一批地方特色高水平大學和第一批綜合改革試點學校、國家“特色重點學科項目”建設(shè)高校、國家建設(shè)高水平大學公派研究生項目、國家級大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃、國家藥品臨床研究基地、中國政府獎學金來華留學生接收院校、教育部“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃”試點高校，長三角醫(yī)學教育聯(lián)盟創(chuàng)始成員。
學校前身是1926年5月創(chuàng)辦的上海東南醫(yī)學院。1949年底，響應(yīng)中共中央華東局“面向農(nóng)村，走向內(nèi)地”的號召，東南醫(yī)學院內(nèi)遷安徽省，成為安徽省第一所高等醫(yī)科院校。1952年改名為安徽醫(yī)學院。1985年更名安徽醫(yī)科大學。